Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCT8L2Q96SF2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCT8L2Q96SF2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCT8L2Q96SF2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCT8L2Q96SF2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CCT8L2Q96SF2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCT8L2Q96SF2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCT8L2Q96SF2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCT8L2Q96SF2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCT8L2Q96SF2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCT8L2Q96SF2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCT8L2Q96SF2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCT8L2Q96SF2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCT8L2Q96SF2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCT8L2Q96SF2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCT8L2Q96SF2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCT8L2Q96SF2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCT8L2Q96SF2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCT8L2Q96SF2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCT8L2Q96SF2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCT8L2Q96SF2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT8L2Q96SF2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT8L2Q96SF2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT8L2Q96SF2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCT8L2Q96SF2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCT8L2Q96SF2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCT8L2Q96SF2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCT8L2Q96SF2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCT8L2Q96SF2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCT8L2Q96SF2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCT8L2Q96SF2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT8L2Q96SF2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCT8L2Q96SF2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCT8L2Q96SF2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCT8L2Q96SF2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCT8L2Q96SF2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCT8L2Q96SF2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCT8L2Q96SF2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCT8L2Q96SF2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCT8L2Q96SF2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCT8L2Q96SF2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCT8L2Q96SF2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCT8L2Q96SF2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCT8L2Q96SF2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCT8L2Q96SF2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCT8L2Q96SF2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCT8L2Q96SF2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCT8L2Q96SF2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms