Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF12Q96QT6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF12Q96QT6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF12Q96QT6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF12Q96QT6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms