Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALPK1Q96QP1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALPK1Q96QP1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALPK1Q96QP1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms