Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCLT1Q96NL6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCLT1Q96NL6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCLT1Q96NL6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCLT1Q96NL6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCLT1Q96NL6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCLT1Q96NL6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCLT1Q96NL6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCLT1Q96NL6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCLT1Q96NL6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCLT1Q96NL6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCLT1Q96NL6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCLT1Q96NL6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCLT1Q96NL6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCLT1Q96NL6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCLT1Q96NL6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCLT1Q96NL6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCLT1Q96NL6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCLT1Q96NL6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCLT1Q96NL6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCLT1Q96NL6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCLT1Q96NL6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCLT1Q96NL6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCLT1Q96NL6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCLT1Q96NL6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCLT1Q96NL6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SCLT1Q96NL6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCLT1Q96NL6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCLT1Q96NL6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCLT1Q96NL6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCLT1Q96NL6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCLT1Q96NL6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCLT1Q96NL6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCLT1Q96NL6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCLT1Q96NL6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCLT1Q96NL6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCLT1Q96NL6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCLT1Q96NL6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCLT1Q96NL6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms