Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF48Q96MX3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF48Q96MX3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF48Q96MX3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF48Q96MX3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF48Q96MX3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF48Q96MX3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF48Q96MX3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF48Q96MX3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF48Q96MX3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms