Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CFAP53Q96M91 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CFAP53Q96M91 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CFAP53Q96M91 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CFAP53Q96M91 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CFAP53Q96M91 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CFAP53Q96M91 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CFAP53Q96M91 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CFAP53Q96M91 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CFAP53Q96M91 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CFAP53Q96M91 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CFAP53Q96M91 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CFAP53Q96M91 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CFAP53Q96M91 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CFAP53Q96M91 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CFAP53Q96M91 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP53Q96M91 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP53Q96M91 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP53Q96M91 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFAP53Q96M91 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFAP53Q96M91 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFAP53Q96M91 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP53Q96M91 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFAP53Q96M91 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CFAP53Q96M91 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFAP53Q96M91 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFAP53Q96M91 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CFAP53Q96M91 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFAP53Q96M91 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFAP53Q96M91 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFAP53Q96M91 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFAP53Q96M91 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFAP53Q96M91 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CFAP53Q96M91 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFAP53Q96M91 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CFAP53Q96M91 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFAP53Q96M91 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFAP53Q96M91 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CFAP53Q96M91 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CFAP53Q96M91 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFAP53Q96M91 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFAP53Q96M91 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFAP53Q96M91 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CFAP53Q96M91 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CFAP53Q96M91 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFAP53Q96M91 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFAP53Q96M91 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CFAP53Q96M91 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFAP53Q96M91 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFAP53Q96M91 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFAP53Q96M91 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFAP53Q96M91 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms