Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF354BQ96LW1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF354BQ96LW1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF354BQ96LW1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF354BQ96LW1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF354BQ96LW1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF354BQ96LW1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF354BQ96LW1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF354BQ96LW1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF354BQ96LW1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF354BQ96LW1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF354BQ96LW1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF354BQ96LW1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF354BQ96LW1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF354BQ96LW1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF354BQ96LW1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF354BQ96LW1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF354BQ96LW1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF354BQ96LW1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF354BQ96LW1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF354BQ96LW1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF354BQ96LW1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF354BQ96LW1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF354BQ96LW1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF354BQ96LW1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF354BQ96LW1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms