Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C8orf48Q96LL4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
C8orf48Q96LL4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C8orf48Q96LL4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C8orf48Q96LL4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C8orf48Q96LL4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C8orf48Q96LL4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C8orf48Q96LL4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C8orf48Q96LL4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C8orf48Q96LL4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
C8orf48Q96LL4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C8orf48Q96LL4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
C8orf48Q96LL4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
C8orf48Q96LL4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C8orf48Q96LL4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C8orf48Q96LL4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C8orf48Q96LL4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C8orf48Q96LL4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C8orf48Q96LL4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C8orf48Q96LL4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C8orf48Q96LL4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C8orf48Q96LL4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C8orf48Q96LL4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C8orf48Q96LL4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
C8orf48Q96LL4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C8orf48Q96LL4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C8orf48Q96LL4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C8orf48Q96LL4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C8orf48Q96LL4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C8orf48Q96LL4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C8orf48Q96LL4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C8orf48Q96LL4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C8orf48Q96LL4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C8orf48Q96LL4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C8orf48Q96LL4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C8orf48Q96LL4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C8orf48Q96LL4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C8orf48Q96LL4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C8orf48Q96LL4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C8orf48Q96LL4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C8orf48Q96LL4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C8orf48Q96LL4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C8orf48Q96LL4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
C8orf48Q96LL4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C8orf48Q96LL4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C8orf48Q96LL4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C8orf48Q96LL4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C8orf48Q96LL4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C8orf48Q96LL4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C8orf48Q96LL4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C8orf48Q96LL4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C8orf48Q96LL4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
C8orf48Q96LL4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
C8orf48Q96LL4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C8orf48Q96LL4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C8orf48Q96LL4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C8orf48Q96LL4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C8orf48Q96LL4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C8orf48Q96LL4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C8orf48Q96LL4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C8orf48Q96LL4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C8orf48Q96LL4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms