Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COX4I2Q96KJ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COX4I2Q96KJ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COX4I2Q96KJ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COX4I2Q96KJ9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms