Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PGBD1Q96JS3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PGBD1Q96JS3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PGBD1Q96JS3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PGBD1Q96JS3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PGBD1Q96JS3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PGBD1Q96JS3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PGBD1Q96JS3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PGBD1Q96JS3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PGBD1Q96JS3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PGBD1Q96JS3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PGBD1Q96JS3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PGBD1Q96JS3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PGBD1Q96JS3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PGBD1Q96JS3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PGBD1Q96JS3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PGBD1Q96JS3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PGBD1Q96JS3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PGBD1Q96JS3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PGBD1Q96JS3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PGBD1Q96JS3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PGBD1Q96JS3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PGBD1Q96JS3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PGBD1Q96JS3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PGBD1Q96JS3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PGBD1Q96JS3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PGBD1Q96JS3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PGBD1Q96JS3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PGBD1Q96JS3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PGBD1Q96JS3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1187.4 ms