Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF479Q96JC4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF479Q96JC4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms