Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRIG1Q96JA1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRIG1Q96JA1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRIG1Q96JA1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRIG1Q96JA1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRIG1Q96JA1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms