Protein–RNA interactions for Protein: Q96J84

KIRREL1, Kin of IRRE-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL1Q96J84 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KIRREL1Q96J84 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIRREL1Q96J84 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIRREL1Q96J84 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIRREL1Q96J84 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIRREL1Q96J84 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIRREL1Q96J84 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIRREL1Q96J84 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIRREL1Q96J84 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIRREL1Q96J84 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIRREL1Q96J84 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIRREL1Q96J84 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIRREL1Q96J84 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIRREL1Q96J84 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIRREL1Q96J84 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KIRREL1Q96J84 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms