Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHDQ96IW2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHDQ96IW2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHDQ96IW2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SHDQ96IW2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHDQ96IW2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHDQ96IW2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SHDQ96IW2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHDQ96IW2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHDQ96IW2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHDQ96IW2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHDQ96IW2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHDQ96IW2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHDQ96IW2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHDQ96IW2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHDQ96IW2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SHDQ96IW2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHDQ96IW2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHDQ96IW2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHDQ96IW2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHDQ96IW2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHDQ96IW2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHDQ96IW2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHDQ96IW2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHDQ96IW2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHDQ96IW2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHDQ96IW2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHDQ96IW2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHDQ96IW2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms