Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRELD1Q96HD1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRELD1Q96HD1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRELD1Q96HD1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRELD1Q96HD1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRELD1Q96HD1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRELD1Q96HD1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRELD1Q96HD1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRELD1Q96HD1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRELD1Q96HD1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRELD1Q96HD1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRELD1Q96HD1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRELD1Q96HD1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRELD1Q96HD1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRELD1Q96HD1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRELD1Q96HD1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRELD1Q96HD1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRELD1Q96HD1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRELD1Q96HD1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRELD1Q96HD1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CRELD1Q96HD1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRELD1Q96HD1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRELD1Q96HD1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRELD1Q96HD1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRELD1Q96HD1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRELD1Q96HD1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRELD1Q96HD1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRELD1Q96HD1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRELD1Q96HD1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRELD1Q96HD1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRELD1Q96HD1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms