Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB39BQ96DA2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB39BQ96DA2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB39BQ96DA2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms