Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFHD2Q96C19 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFHD2Q96C19 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFHD2Q96C19 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFHD2Q96C19 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFHD2Q96C19 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFHD2Q96C19 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFHD2Q96C19 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFHD2Q96C19 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFHD2Q96C19 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms