Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms