Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGMAQ96B86 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGMAQ96B86 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGMAQ96B86 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGMAQ96B86 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMAQ96B86 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMAQ96B86 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMAQ96B86 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMAQ96B86 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMAQ96B86 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMAQ96B86 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMAQ96B86 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMAQ96B86 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMAQ96B86 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMAQ96B86 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGMAQ96B86 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGMAQ96B86 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGMAQ96B86 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms