Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH0

NABP1, SOSS complex subunit B2, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP1Q96AH0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NABP1Q96AH0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NABP1Q96AH0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NABP1Q96AH0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NABP1Q96AH0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NABP1Q96AH0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NABP1Q96AH0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NABP1Q96AH0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NABP1Q96AH0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NABP1Q96AH0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NABP1Q96AH0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NABP1Q96AH0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NABP1Q96AH0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NABP1Q96AH0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms