Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FUBP1Q96AE4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FUBP1Q96AE4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FUBP1Q96AE4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FUBP1Q96AE4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FUBP1Q96AE4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FUBP1Q96AE4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FUBP1Q96AE4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FUBP1Q96AE4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FUBP1Q96AE4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FUBP1Q96AE4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms