Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3Q969T4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2E3Q969T4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2E3Q969T4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms