Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM54Q969K7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM54Q969K7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM54Q969K7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM54Q969K7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM54Q969K7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM54Q969K7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms