Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CUL5Q93034 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CUL5Q93034 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CUL5Q93034 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CUL5Q93034 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CUL5Q93034 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CUL5Q93034 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CUL5Q93034 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CUL5Q93034 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CUL5Q93034 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CUL5Q93034 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CUL5Q93034 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CUL5Q93034 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CUL5Q93034 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CUL5Q93034 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CUL5Q93034 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CUL5Q93034 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CUL5Q93034 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CUL5Q93034 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CUL5Q93034 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CUL5Q93034 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CUL5Q93034 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CUL5Q93034 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CUL5Q93034 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CUL5Q93034 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CUL5Q93034 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CUL5Q93034 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CUL5Q93034 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CUL5Q93034 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CUL5Q93034 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CUL5Q93034 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CUL5Q93034 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CUL5Q93034 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CUL5Q93034 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CUL5Q93034 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CUL5Q93034 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CUL5Q93034 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CUL5Q93034 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CUL5Q93034 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CUL5Q93034 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CUL5Q93034 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CUL5Q93034 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CUL5Q93034 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms