Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP7Q93009 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP7Q93009 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP7Q93009 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP7Q93009 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP7Q93009 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP7Q93009 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP7Q93009 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP7Q93009 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP7Q93009 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP7Q93009 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP7Q93009 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP7Q93009 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP7Q93009 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP7Q93009 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP7Q93009 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP7Q93009 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP7Q93009 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP7Q93009 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP7Q93009 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP7Q93009 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP7Q93009 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP7Q93009 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP7Q93009 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP7Q93009 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP7Q93009 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP7Q93009 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP7Q93009 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP7Q93009 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP7Q93009 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP7Q93009 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP7Q93009 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP7Q93009 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP7Q93009 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP7Q93009 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP7Q93009 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP7Q93009 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP7Q93009 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP7Q93009 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP7Q93009 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP7Q93009 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP7Q93009 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP7Q93009 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP7Q93009 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP7Q93009 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP7Q93009 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP7Q93009 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP7Q93009 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP7Q93009 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP7Q93009 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP7Q93009 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP7Q93009 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP7Q93009 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP7Q93009 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP7Q93009 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP7Q93009 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP7Q93009 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP7Q93009 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP7Q93009 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP7Q93009 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP7Q93009 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP7Q93009 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP7Q93009 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP7Q93009 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP7Q93009 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP7Q93009 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USP7Q93009 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP7Q93009 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP7Q93009 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP7Q93009 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP7Q93009 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP7Q93009 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP7Q93009 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP7Q93009 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP7Q93009 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP7Q93009 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP7Q93009 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP7Q93009 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP7Q93009 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP7Q93009 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP7Q93009 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP7Q93009 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP7Q93009 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP7Q93009 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP7Q93009 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP7Q93009 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP7Q93009 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP7Q93009 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP7Q93009 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP7Q93009 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP7Q93009 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP7Q93009 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP7Q93009 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP7Q93009 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP7Q93009 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP7Q93009 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP7Q93009 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP7Q93009 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP7Q93009 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP7Q93009 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms