Protein–RNA interactions for Protein: Q92781

RDH5, 11-cis retinol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH5Q92781 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH5Q92781 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH5Q92781 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH5Q92781 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms