Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDKL2Q92772 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKL2Q92772 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDKL2Q92772 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDKL2Q92772 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKL2Q92772 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKL2Q92772 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL2Q92772 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL2Q92772 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL2Q92772 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKL2Q92772 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKL2Q92772 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKL2Q92772 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDKL2Q92772 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDKL2Q92772 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKL2Q92772 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms