Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3AQ92664 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3AQ92664 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF3AQ92664 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3AQ92664 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms