Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC9Q92623 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC9Q92623 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC9Q92623 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC9Q92623 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC9Q92623 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC9Q92623 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC9Q92623 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC9Q92623 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC9Q92623 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC9Q92623 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC9Q92623 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC9Q92623 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC9Q92623 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC9Q92623 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC9Q92623 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC9Q92623 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms