Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERVK_113Q902F9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERVK_113Q902F9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HERVK_113Q902F9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERVK_113Q902F9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERVK_113Q902F9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERVK_113Q902F9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERVK_113Q902F9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERVK_113Q902F9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERVK_113Q902F9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERVK_113Q902F9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERVK_113Q902F9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERVK_113Q902F9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERVK_113Q902F9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HERVK_113Q902F9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HERVK_113Q902F9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HERVK_113Q902F9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERVK_113Q902F9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERVK_113Q902F9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HERVK_113Q902F9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HERVK_113Q902F9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
HERVK_113Q902F9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HERVK_113Q902F9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HERVK_113Q902F9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERVK_113Q902F9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERVK_113Q902F9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERVK_113Q902F9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HERVK_113Q902F9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HERVK_113Q902F9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HERVK_113Q902F9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HERVK_113Q902F9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERVK_113Q902F9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERVK_113Q902F9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HERVK_113Q902F9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HERVK_113Q902F9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HERVK_113Q902F9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERVK_113Q902F9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERVK_113Q902F9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HERVK_113Q902F9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HERVK_113Q902F9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERVK_113Q902F9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERVK_113Q902F9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERVK_113Q902F9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HERVK_113Q902F9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HERVK_113Q902F9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HERVK_113Q902F9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HERVK_113Q902F9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HERVK_113Q902F9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HERVK_113Q902F9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERVK_113Q902F9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERVK_113Q902F9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERVK_113Q902F9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERVK_113Q902F9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERVK_113Q902F9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HERVK_113Q902F9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HERVK_113Q902F9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERVK_113Q902F9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERVK_113Q902F9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERVK_113Q902F9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERVK_113Q902F9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HERVK_113Q902F9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERVK_113Q902F9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms