Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNDC9Q8TBE3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNDC9Q8TBE3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FNDC9Q8TBE3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC9Q8TBE3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC9Q8TBE3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms