Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB92

HMGCLL1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLL1Q8TB92 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGCLL1Q8TB92 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGCLL1Q8TB92 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGCLL1Q8TB92 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGCLL1Q8TB92 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGCLL1Q8TB92 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGCLL1Q8TB92 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGCLL1Q8TB92 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGCLL1Q8TB92 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGCLL1Q8TB92 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGCLL1Q8TB92 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGCLL1Q8TB92 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGCLL1Q8TB92 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGCLL1Q8TB92 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGCLL1Q8TB92 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HMGCLL1Q8TB92 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HMGCLL1Q8TB92 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGCLL1Q8TB92 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGCLL1Q8TB92 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGCLL1Q8TB92 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGCLL1Q8TB92 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGCLL1Q8TB92 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGCLL1Q8TB92 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGCLL1Q8TB92 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms