Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEIL3Q8TAT5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEIL3Q8TAT5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEIL3Q8TAT5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEIL3Q8TAT5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms