Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFWD2Q8NHY2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFWD2Q8NHY2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RFWD2Q8NHY2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFWD2Q8NHY2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFWD2Q8NHY2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RFWD2Q8NHY2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms