Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229BQ8NBD8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM229BQ8NBD8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM229BQ8NBD8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM229BQ8NBD8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM229BQ8NBD8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM229BQ8NBD8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM229BQ8NBD8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM229BQ8NBD8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM229BQ8NBD8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM229BQ8NBD8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM229BQ8NBD8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM229BQ8NBD8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM229BQ8NBD8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM229BQ8NBD8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM229BQ8NBD8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM229BQ8NBD8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms