Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD1Q8NB12 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD1Q8NB12 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD1Q8NB12 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD1Q8NB12 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD1Q8NB12 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD1Q8NB12 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD1Q8NB12 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD1Q8NB12 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD1Q8NB12 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD1Q8NB12 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD1Q8NB12 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD1Q8NB12 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD1Q8NB12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD1Q8NB12 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD1Q8NB12 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD1Q8NB12 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD1Q8NB12 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD1Q8NB12 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD1Q8NB12 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD1Q8NB12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD1Q8NB12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD1Q8NB12 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMYD1Q8NB12 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD1Q8NB12 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms