Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC29Q8NA56 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC29Q8NA56 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC29Q8NA56 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC29Q8NA56 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC29Q8NA56 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC29Q8NA56 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC29Q8NA56 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC29Q8NA56 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC29Q8NA56 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC29Q8NA56 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC29Q8NA56 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC29Q8NA56 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC29Q8NA56 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC29Q8NA56 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC29Q8NA56 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms