Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C3

TRIML2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML2, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML2Q8N7C3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIML2Q8N7C3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIML2Q8N7C3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIML2Q8N7C3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIML2Q8N7C3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIML2Q8N7C3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIML2Q8N7C3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIML2Q8N7C3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIML2Q8N7C3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms