Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf62Q8N4C0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf62Q8N4C0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf62Q8N4C0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf62Q8N4C0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf62Q8N4C0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf62Q8N4C0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf62Q8N4C0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf62Q8N4C0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf62Q8N4C0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf62Q8N4C0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf62Q8N4C0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf62Q8N4C0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf62Q8N4C0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf62Q8N4C0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf62Q8N4C0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C9orf62Q8N4C0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf62Q8N4C0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf62Q8N4C0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms