Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GPC2Q8N158 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GPC2Q8N158 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GPC2Q8N158 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GPC2Q8N158 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GPC2Q8N158 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GPC2Q8N158 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GPC2Q8N158 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GPC2Q8N158 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GPC2Q8N158 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
GPC2Q8N158 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GPC2Q8N158 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GPC2Q8N158 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GPC2Q8N158 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GPC2Q8N158 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GPC2Q8N158 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GPC2Q8N158 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GPC2Q8N158 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GPC2Q8N158 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GPC2Q8N158 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GPC2Q8N158 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GPC2Q8N158 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GPC2Q8N158 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GPC2Q8N158 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GPC2Q8N158 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GPC2Q8N158 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GPC2Q8N158 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GPC2Q8N158 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GPC2Q8N158 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GPC2Q8N158 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GPC2Q8N158 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GPC2Q8N158 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GPC2Q8N158 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GPC2Q8N158 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GPC2Q8N158 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GPC2Q8N158 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GPC2Q8N158 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GPC2Q8N158 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GPC2Q8N158 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GPC2Q8N158 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GPC2Q8N158 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GPC2Q8N158 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GPC2Q8N158 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GPC2Q8N158 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GPC2Q8N158 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GPC2Q8N158 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GPC2Q8N158 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GPC2Q8N158 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GPC2Q8N158 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GPC2Q8N158 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
GPC2Q8N158 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GPC2Q8N158 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms