Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGI4Q8N135 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGI4Q8N135 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGI4Q8N135 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LGI4Q8N135 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms