Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZR5

CMTM4, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4Q8IZR5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM4Q8IZR5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM4Q8IZR5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM4Q8IZR5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM4Q8IZR5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM4Q8IZR5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM4Q8IZR5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CMTM4Q8IZR5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMTM4Q8IZR5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMTM4Q8IZR5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMTM4Q8IZR5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM4Q8IZR5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTM4Q8IZR5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMTM4Q8IZR5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms