Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC103Q8IW40 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC103Q8IW40 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC103Q8IW40 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC103Q8IW40 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC103Q8IW40 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC103Q8IW40 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC103Q8IW40 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC103Q8IW40 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC103Q8IW40 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC103Q8IW40 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC103Q8IW40 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC103Q8IW40 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC103Q8IW40 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC103Q8IW40 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC103Q8IW40 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms