Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL1

NAV2, Neuron navigator 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAV2Q8IVL1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAV2Q8IVL1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAV2Q8IVL1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAV2Q8IVL1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAV2Q8IVL1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAV2Q8IVL1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAV2Q8IVL1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAV2Q8IVL1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAV2Q8IVL1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NAV2Q8IVL1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NAV2Q8IVL1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAV2Q8IVL1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAV2Q8IVL1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAV2Q8IVL1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAV2Q8IVL1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAV2Q8IVL1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAV2Q8IVL1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAV2Q8IVL1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAV2Q8IVL1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NAV2Q8IVL1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAV2Q8IVL1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAV2Q8IVL1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAV2Q8IVL1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NAV2Q8IVL1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAV2Q8IVL1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAV2Q8IVL1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAV2Q8IVL1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAV2Q8IVL1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms