Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB43Q86YS6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB43Q86YS6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB43Q86YS6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB43Q86YS6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB43Q86YS6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB43Q86YS6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB43Q86YS6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB43Q86YS6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB43Q86YS6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB43Q86YS6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB43Q86YS6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB43Q86YS6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB43Q86YS6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB43Q86YS6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB43Q86YS6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB43Q86YS6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB43Q86YS6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB43Q86YS6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB43Q86YS6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB43Q86YS6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB43Q86YS6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB43Q86YS6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB43Q86YS6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB43Q86YS6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms