Protein–RNA interactions for Protein: Q86VW1

SLC22A16, Solute carrier family 22 member 16, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A16Q86VW1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A16Q86VW1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A16Q86VW1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A16Q86VW1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A16Q86VW1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC22A16Q86VW1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC22A16Q86VW1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A16Q86VW1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC22A16Q86VW1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC22A16Q86VW1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC22A16Q86VW1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC22A16Q86VW1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC22A16Q86VW1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC22A16Q86VW1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms