Protein–RNA interactions for Protein: Q86UE6

LRRTM1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1Q86UE6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM1Q86UE6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRTM1Q86UE6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRTM1Q86UE6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRTM1Q86UE6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms