Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLNKQ7Z7G1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLNKQ7Z7G1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLNKQ7Z7G1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLNKQ7Z7G1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLNKQ7Z7G1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms