Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRGAP1Q7Z6B7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SRGAP1Q7Z6B7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRGAP1Q7Z6B7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP1Q7Z6B7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP1Q7Z6B7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRGAP1Q7Z6B7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRGAP1Q7Z6B7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRGAP1Q7Z6B7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRGAP1Q7Z6B7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRGAP1Q7Z6B7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRGAP1Q7Z6B7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP1Q7Z6B7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SRGAP1Q7Z6B7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRGAP1Q7Z6B7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms