Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPP1R42Q7Z4L9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PPP1R42Q7Z4L9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPP1R42Q7Z4L9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPP1R42Q7Z4L9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PPP1R42Q7Z4L9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PPP1R42Q7Z4L9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPP1R42Q7Z4L9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPP1R42Q7Z4L9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPP1R42Q7Z4L9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PPP1R42Q7Z4L9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPP1R42Q7Z4L9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPP1R42Q7Z4L9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPP1R42Q7Z4L9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPP1R42Q7Z4L9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPP1R42Q7Z4L9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPP1R42Q7Z4L9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PPP1R42Q7Z4L9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPP1R42Q7Z4L9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPP1R42Q7Z4L9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPP1R42Q7Z4L9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PPP1R42Q7Z4L9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPP1R42Q7Z4L9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PPP1R42Q7Z4L9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PPP1R42Q7Z4L9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PPP1R42Q7Z4L9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PPP1R42Q7Z4L9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPP1R42Q7Z4L9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPP1R42Q7Z4L9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPP1R42Q7Z4L9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPP1R42Q7Z4L9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PPP1R42Q7Z4L9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PPP1R42Q7Z4L9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PPP1R42Q7Z4L9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PPP1R42Q7Z4L9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PPP1R42Q7Z4L9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PPP1R42Q7Z4L9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PPP1R42Q7Z4L9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PPP1R42Q7Z4L9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPP1R42Q7Z4L9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPP1R42Q7Z4L9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPP1R42Q7Z4L9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPP1R42Q7Z4L9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPP1R42Q7Z4L9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPP1R42Q7Z4L9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PPP1R42Q7Z4L9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms